En los últimos 15 años, la microbiota intestinal se ha relacionado con enfermedades del aparato digestivo, así como con otras relacionadas indirectamente con este sistema. La microbiota intestinal no solo está compuesta por bacterias, sino que también la forman grupos minoritarios de otros microorganismos como virus, hongos y arqueas. En la actualidad, los efectos que tienen los antibióticos sobre la microbiota bacteriana se han descrito en numerosos artículos; sin embargo, se desconoce el impacto que pueden causar sobre la microbiota fúngica. Por ello, este artículo tiene como objetivo analizar el efecto de un antibiótico de amplio espectro, sobre las modificaciones en la composición bacteriana y fúngica intestinales.
En el estudio realizado por Madeline Spatz y colaboradores se recogieron muestras fecales de 7 bebés lactantes, entre 2 y 4 meses de edad, a diferentes tiempos; ante, durante y tras finalizar tratamiento con antibióticos (con amoxicilina-ácido clavulánico o con un pool de antibióticos). Dichas muestras se procesaron y prepararon para realizar trasplantes de microbiota fecal (FMT, de sus siglas en inglés) en modelos murinos con genotipo C57BL/6J.
Según el análisis, los ratones fueron tratados exclusivamente con un tipo de antibiótico u otro, o en combinación con bacterias y hongos previamente cultivados. Tras los diferentes tratamientos, estos animales fueron eutanasiados por dislocación cervical y se les extrajo el colon, el íleon, el estómago y el contenido cecal y fecal, para estudiar su composición microbiana. En estas muestras, se llevaron a cabo determinaciones bioquímicas (cuantificando la mieloperoxidasa y la lipocalina-2 fecal) y estudios de expresión génica mediante qPCR.
Los resultados de diversidad alfa a nivel intestinal se evaluaron mediante el índice de Shannon, observando que la población bacteriana disminuye considerablemente en el grupo sometido a tratamiento antibiótico con respecto al grupo control. Se observó, así mismo, que la población fúngica también disminuye, pero en menor medida. Paralelamente, se estudió la diversidad beta utilizando el índice de Jaccard, diferenciándose también dos grupos significativamente separados entre los ratones del grupo control y aquellos que habían estado sometidos a tratamiento.
A pesar de observar una gran disminución en muchas familias de bacterias, se demostró mediante un análisis linear diferencial que las familias de las clostridiales, las enterobacterias y las enterococáceas, aumentaron significativamente tras el tratamiento con amoxicilina; hecho que se corroboró tras realizar dos experimentos in vivo con la vancomicina y la colistina. El análisis de resultados demostró que, de forma general, el uso de antibióticos disminuye considerablemente la cantidad microbiana bacteriana y fúngica.
Esta investigación pone en evidencia los efectos deletéreos de la utilización de antibióticos de amplio espectro sobre la microbiota intestinal. Sin embargo, no pudo verificarse el paradigma que establece que después de cualquier tratamiento antibiótico, la microbiota fúngica se beneficia de la liberación de la competencia. Por este motivo, en Pronacera apostamos por evaluar el estado de salud de cada persona desde un punto de vista multidisciplinar e integrativo, basándonos en pruebas ómicas, como la que evalúa el Microbioma Intestinal, aplicando diferentes técnicas moleculares que nos permiten evaluar el bacterioma, el microbioma y el viroma con este fin.
Madeline Spatz, Gregory Da Costa, Rebecka Ventin-Holmberg, Julien Planchais, Chloé Michaudel, Yazhou Wang, Camille Danne, Alexia Lapiere, Marie-Laure Michel, Kaija-Leena Kolho, Philippe Langella, Harry Sokol, Mathias L Richard.
Https://doi.org/10.1186/s40168-023-01516-y
